بعد حادثة الكنيسة البطرسية في العباسية وكعادة الإعلام المصري تكون أصابع الاتهام مشارة في البدء إلى جماعة الإخوان المسلمين ومؤيديها، سواء من أشخاص أو مؤسسات أو دول، وردد بعض الإعلاميين تورط قطر في تفجير الكنيسة البطرسية وهي تصريحات في منتهى الخطورة، رفضها مجلس التعاون الخليجي بشكل قاطع وحذر مصر من أن تلك التصريحات قد تهدد العلاقات العربية.
حيث صرح الدكتور عبد اللطيف الزياني، بأن المجلس يتضامن مع مصر في حربها ضد الأرهاب ويدعمها بكل ما يملك، إلا أنه في نفس الوقت يرفض الاتهامات المصرية لدولة قطر بتورطها في حادثة تفجير الكنيسة البطرسية، محذراً مصر من أن تلك التصريحات تهدد علاقة المجلس مع مصر.
جدير بالذكر أن الفترة الأخيرة قد شهدت توتر بين مصر ودول الخليج بشكل عام، وبينها وبين المملكة العربية السعودية بشكل خاص.